Det anbefales å lagre Melanotan-II ved -20 grader. Lave temperaturer reduserer kjemiske reaksjonshastigheter og reduserer sannsynligheten for reaksjoner med miljøfaktorer som oksygen og fuktighet, og forhindrer derved nedbrytning, oksidasjon eller andre former for ødeleggelse.
Sørg for at emballasjen er tett forseglet under lagring for å hindre inntrenging av luft og fuktighet. Unngå gjentatte fryse-tiningssykluser, da disse kan føre til peptidaggregering, redusert aktivitet eller strukturell skade, som alle kompromitterer effektiviteten. Hvis flere bruksområder er nødvendig, alikvoter produktet i mindre porsjoner og hent en enkelt porsjon for hver bruk.